ggplot2 :: errorbar 와 point로 그린 forest plot 조금 꾸미기

말 그대로 조금 꾸미기..

ggplot2 는 정말 많은 옵션들이 있지만

 

사용하는게 왜이리 어려운지 모르겠다.

음.. 너무 많아서 그런가? 

같은 역할을 하는데도 구글링하면 온갖 이름으로 나와서 그런가.. 

사실 모든 결론은 내가 '익숙하지 못해서'이다.

(익숙해지지가 않는다..)

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해당 포스팅은 R코드들을 개인적으로 정리하고자 작성하였습니다.

※ 혹시 잘못된 곳이 있거나 의견있으시면 알려주세요!

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시작은 forest plot을 다 그린 시점부터

 

이전포스팅 참고..

https://stat-rage.tistory.com/2

ggplot2 :: errorbar 와 point 로 forest plot 그리기

 

ggplot(table, aes(y = rownames(table), x = HR)) +
	geom_errorbar(aes(xmin = lower, xmax = upper), width = 0, size = 1) +
        geom_point(fill = "royalblue", size = 3, shape = 23) +
        ylim(rev(rownames(table))

뭘 해볼까.. 

꾸민다는 것은 매우 주관적이기 때문에..

뭐 여튼 자주 사용하는 옵션만 정리해보자..

 

#1. point

## 1-1. point 색상

	geom_point(color = ~

로 색상 옵션을 주면 선 색만 바뀐다.

PPT 도형 옵션에 선색과 채우기 색이 따로있는 것 처럼 

point 는 color 는 선색 / fill 은 채우기 색상을 변경해준다.

# 선색
    geom_point(color = ~
    
# 채우기 색
    geom_point(fill = ~

왼쪽 부터, color = "royalblue" / fill = "royalblue" / color = "red",  fill = "blue"

 

#2. x 축 scale 조정

보통 forest plot 하면 기준을 많이 잡고 그리는 편

특히 HR은 1을 기준으로 그린다.

 

보통 0.1부터 10 까지 대칭으로 나타낸다. log를 이용하기 때문에 0으로 하면 안됨.

	scale_x_log10(limits = c(0.1,10), breaks = c(0.1,1,10))

limit는 범위, breaks는 축에 나타내는 점을 표시한다.

위 코드를 + 로 추가 시켜주면 다음과 같이 나타난다.

 

 

#3. x = 1 기준선 추가

기준선을 추가해서 해석을 조금 쉽게 한다.

간단하게 vline을 추가한다.

	geom_vline(aes(xintercept = 1), linetype = "~", size = ~, alpha = ~, col = "~")

y축으로 줄을 그으려면 hline & yintercept 

linetype이나 size 투명도(alpha)를 설정 할 수 있다.

#4. 테마 & 패널

하얀 배경을 선호하기 때문에 간단하게 다음 코드를 추가하면 된다.

	theme_classic2()

figure의 borderline을 추가하려면 다음의 코드를 추가하면 된다.

	theme(panel.border = element_rect(colour = "black", fill = NA, size = 0.5), panel.background = element_blank())

border도 옵션을 당연히 줄 수 있다.

 

오늘은 여기까지!

긴 글 읽어주셔서 감사합니다.